Simulation mésoscopique

• https://fr.wikipedia.org/wiki/Dynamique_des_particules_dissipatives DPD Simulation etc, pile poil dans le topic
  • page bien augmentée par moi, voir surtout le § logiciels

• Les méthodes multi-échelles dites de coarse-graining sonta ce jour la seule option réaliste pour modéliser des systemes de tailles mésoscopique avec une résolution atomistique. La Dynamique des Particules Dissipatives (DPD), et sa variante la DPDE, utilisée pour modéliser des systemes hors-équilibre sont de telles méthodes.
• de fait, il existe déjà un paquet de logiciels de simulation, basés sur des techniques récentes, raffinés algorithmiquement, et dont l'écriture a du coûter qqs hommes-années + de bonnes connaissances physico-chimiques ... dont plusieurs logiciels open
• (... donc on peut s'interroger sur l'opportunité de se lancer seul dans un tel travail)

• http://www.dpdforum.org

• http://lpcm.recherche.usherbrooke.ca/PDF/Ms_Palato.pdf thèse fr, lisible

• http://scd-theses.u-strasbg.fr/1911/01/KHALIL_Mouhamad_2010.pdf suspensions colloïdales sous écoulement

• https://fr.wikipedia.org/wiki/Dynamique_moléculaire

• http://philippe.gascuel.pagesperso-orange.fr/notice1.htm ... affreux mélange avec de la politique, mais néanmoins des idées intéressantes

Applications

• https://www.seas.harvard.edu/brenner/Home.html réplication
  • http://www.pnas.org/content/111/5/1748.full semble réplication, intéressant. Je n'ai pas vu mentionné le ou les logiciels employés ? sans doute homemade ?

à part l'appli ci-dessus, revendiquée concernant les living systems, je n'ai pas vu trop d'applications coté biologie, prébiologie ... mais ce serait très étonnant qu'il n'y en ait pas.

Pages connexes

• Vie/Simulation