Simulation mésoscopique : Différence entre versions

Version actuelle datée du 31 mai 2017 à 08:57

• https://fr.wikipedia.org/wiki/Dynamique_des_particules_dissipatives DPD Simulation etc, pile poil dans le topic
  • page augmentée par moi, voir surtout le § logiciels

• Les méthodes multi-échelles dites de coarse-graining sont à ce jour la seule option réaliste pour modéliser des systèmes de tailles mésoscopique avec une résolution atomistique. La Dynamique des Particules Dissipatives (DPD), et sa variante la DPDE, utilisée pour modéliser des systemes hors-équilibre sont de telles méthodes. (http://smai.emath.fr/smai2015/resumesPDF/ahmedamine/Abstract.pdf)

• de fait, il existe déjà un paquet de logiciels de simulation, basés sur des techniques récentes, raffinés algorithmiquement, et dont l'écriture a du coûter qqs hommes-années + de bonnes connaissances physico-chimiques ... dont plusieurs logiciels open

• (... donc on peut s'interroger sur l'opportunité de se lancer seul dans une resucée d'un tel travail)

Liens

• http://www.dpdforum.org

• http://lpcm.recherche.usherbrooke.ca/PDF/Ms_Palato.pdf thèse fr, lisible

• http://scd-theses.u-strasbg.fr/1911/01/KHALIL_Mouhamad_2010.pdf suspensions colloïdales sous écoulement

• https://fr.wikipedia.org/wiki/Dynamique_moléculaire

• http://philippe.gascuel.pagesperso-orange.fr/notice1.htm ... affreux mélange avec de la politique, mais néanmoins des idées intéressantes

Applications

• https://www.seas.harvard.edu/brenner/Home.html réplication
  • http://www.pnas.org/content/111/5/1748.full semble réplication, intéressant. Je n'ai pas vu mentionné le ou les logiciels employés ? sans doute homemade ?

à part l'appli ci-dessus, revendiquée concernant les living systems, je n'ai pas vu trop d'applications coté biologie, prébiologie ... mais ce serait très étonnant qu'il n'y en ait pas.

Autres algorithmes

• https://fr.wikipedia.org/wiki/Méthode_de_Monte-Carlo_cinétique
  • L'algorithme Monte-Carlo cinétique est utilisé pour simuler les phénomènes physiques tels que la diffusion de surface, l'épitaxie, l'évolution et la croissance de domaines ou la mobilité des agrégats.

• automates cellulaires

Pages connexes

• Vie/Simulation